湖州市疾病預防控制中心是在原湖州市衛生防疫站基礎上于2001年6月組建而成的公益性事業單位。主要承擔疾病預防與控制、突發公共衛生事件應急處置、疫情及健康相關因素信息管理、健康危害因素監測與控制、實驗室檢測分析與評價、健康教育與健康促進、技術指導與應用研究等職能，是全市疾病預防與控制的技術指導中心和技術咨詢服務機構。