宿遷市食品藥品檢驗所是2002年3月經省編委批準，在原宿城區藥品檢驗所的基礎上組建起來的地市所（宿遷藥檢所），獨立法人單位，核定編制22人。2010年由市政府下文更名為宿遷市食品藥品檢驗所，核編25人，2013年增加“藥品不良反應監測中心”，增編3人，核編28人。現有面積8000m2。現核編28人，在崗人員26人，其中從事藥品檢驗及檢驗報告審核的技術人員17人，全所共有副高職稱2人，中級職稱13人，初級職稱11人。目前全所共設所部、辦公室、業務管理室、化學室、藥理室和中藥室等6個科室。